Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms