Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms