Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPFP62306 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms