Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC044839.1-208ENST00000634902 917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC023050.4-201ENST00000538830 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL360268.1-201ENST00000453870 765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ZEB2P1-202ENST00000572816 902 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms