Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms