Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDSP20132 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDSP20132 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SDSP20132 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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