Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms