Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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PF4P02776 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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PF4P02776 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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PF4P02776 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PF4P02776 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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PF4P02776 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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PF4P02776 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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PF4P02776 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PF4P02776 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PF4P02776 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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