Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms