Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDP2Q9P2J9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDP2Q9P2J9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDP2Q9P2J9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDP2Q9P2J9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDP2Q9P2J9 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDP2Q9P2J9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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