Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms