Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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