Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms