Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms