Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms