Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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