Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
TSTA3Q13630 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
TSTA3Q13630 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TSTA3Q13630 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TSTA3Q13630 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms