Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms