Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPIBQ01892 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.8 ms