Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms