Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZBED6P86452 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms