Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KCND2-201ENST00000331113 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NRAP-203ENST00000369358 5534 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 XRRA1-201ENST00000321448 4695 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 AC026369.1-202ENST00000508953 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HERVK_113P61574 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms