Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ACTBP60709 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ACTBP60709 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ACTBP60709 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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