Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms