Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GJC1P36383 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJC1P36383 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJC1P36383 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJC1P36383 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GJC1P36383 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms