Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MARCKSP29966 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms