Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms