Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJB2P29033 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJB2P29033 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJB2P29033 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJB2P29033 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJB2P29033 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms