Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDSP20132 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDSP20132 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDSP20132 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms