Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP2B1P20020 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2B1P20020 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms