Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms