Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
MAP3K4Q9Y6R4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAP3K4Q9Y6R4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms