Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3AQ9Y6K1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3AQ9Y6K1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms