Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD54BQ9Y620 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD54BQ9Y620 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms