Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms