Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL4A3BPQ9Y5P4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL4A3BPQ9Y5P4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms