Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms