Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP4S1Q9Y587 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP4S1Q9Y587 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms