Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFG3L2Q9Y4W6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms