Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3KQ9Y2Y1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3KQ9Y2Y1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3KQ9Y2Y1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3KQ9Y2Y1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR3KQ9Y2Y1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLR3KQ9Y2Y1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR3KQ9Y2Y1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms