Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BTRCQ9Y297 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BTRCQ9Y297 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms