Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF13BQ9Y275 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF13BQ9Y275 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms