Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HPS5Q9UPZ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS5Q9UPZ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms