Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CEP164Q9UPV0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP164Q9UPV0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms