Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP22Q9UPT9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms