Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPK3Q9UPE1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRPK3Q9UPE1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
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