Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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