Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX7Q9UNH6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX7Q9UNH6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms