Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX12Q9UMY4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms