Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHTF1Q9UMS5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms